本文会探讨它们之间的联系。

一、京东POP店的定义及其与旗舰店的关系

京东 POP 店，全称为 Open Plan，也就是平台开放计划。它是京东对外开放的一种店铺模式，能够允许第三方商家在京东平台上开设店铺，进而进行商品销售。

POP 店包含多种类型，如旗舰店、专卖店以及专营店等。其中，旗舰店是 POP 店的一种形式，一般来讲，它是一个品牌在京东平台上的唯一官方店铺，专门用于销售该品牌的产品。所以，旗舰店属于 POP 店，然而，POP 店不只是有旗舰店，还包含其他类型的店铺。

二、POP店和自营店的区别

京东 POP 店的发货模式和京东自营店也存在差别。

京东自营店的运营模式为 B2B2C 模式，京东负责采购商品并进行销售；POP 店的运营模式是 B2C 模式，商家直接面向消费者销售商品。

自营店的结算方式较为多样，其中包含毛保以及返点等形式。POP 店的结算主要是扣点结算，其扣点比例通常在 2%到 6%之间。

京东自营店在流量和店铺排名方面具有天然优势，这与 POP 店不同。POP 店需要通过优化和活动来争取流量，而京东自营店无需如此。

自营店的发货模式有两种，一是可以选择入仓，二是可以选择厂家直送；POP 店的发货方式主要有两种，一是厂家配送，二是入京仓。

综上所述，京东 POP 店与旗舰店不同。旗舰店是 POP 店中的一种特殊类型。它们的运营模式和特点各异。这为消费者提供了多样化的购物选择，也为商家提供了灵活的经营平台。